Séminaire (organisé par l’équipe de recherche DI)

Riwal LEFORT

Laboratoire GREYC, Université de Caen


Algorithme EM sous contrainte en bio-informatique


Lundi 27 avril 2015 à 14 h en salle GI042

Résumé :

Dans ce séminaire, je présente l’algorithme Expectation-Maximization sous contrainte pour estimer les paramètres d’un mélange de GMM. Cet algorithme étant très sensible aux conditions initiales, je propose deux méthodes d’initialisation. La première s’appuie sur une technique de bootstapping, la seconde sur une quantification vectorielle. Nous appliquons les méthodes proposées en bio-informatique. Afin de comprendre l’effet du génome sur le phénotype des cellules en mouvement dans des vidéos, les biologistes inhibent chaque gène indépendamment. Mais, comme le processus d’inhibition n’est pas maîtrisé, d’autres gènes peuvent être atteints. Les méthodes proposées servent à isoler et modéliser les composantes ciblées et le bruit.



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